من الواضح أن الأمور ليست وردية داخل شركة سيانوجين، حيث اتضح أن هناك عدد من الخلافات الداخلية، التي بلغت ذروتها، مما أدت إلى بعض الإجراءات الجذرية. قال ستيف كونديك في بيانٍ له أن كيرت ماكماستر – شريكه المؤسس – لم يكن راضيًا بالمرة عن أعمال الشركة التجارية، لا سيما فرض رؤيته الخاصة على سيانوجين مود. من هنا بدأت العديد من السخافات، فأغلقت الشركة عدة صفقات، وأصبح مقر الشركة بمثابة كابوس وليس بيئة عمل مريحة كما كان متوقع. لم يصرّح ستيف بأنه ترك الشركة أو أن لديه نية لذلك، لكنه يعني إنه يريد تغيير الأوضاع داخل سيانوجين. كما قال إنه ينوي المُضِيّ قدمًا في مشروع سيانوجين مود، لكن قد يواجه عقبات قانونية كبيرة قد تهدم كل ما أنجزته الشركة. وفي الوقت الحالي فإن نظام تشغيل سيانوجين مود لا يزال مستمرًّا في إنتاج إصدارات جديدة ودعم أجهزة جديدة. واليوم بات إصدار 14.1 – المبني على أندرويد 7.1 نوجا – يتوافق مع سبعة هواتف ذكية جديدة، وهم: